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Ressources de calcul

De son PC aux offres des serveurs nationaux

Il existe 4 niveaux de ressources de calcul :

  • Son PC
    Ordre de grandeur : 50 G Flops
  • Les serveurs nationaux
    Ordre de grandeur : 1 P Flops

Le serveur de calcul disponible au LMB

 1. Vue d’ensemble du matériel

Machine bi-processeur quadri-coeur (architecture 64 bits) :

  • Marque Dell Poweredge R900
  • Processeur Intel Xeon X7350 2,93 GHz, 8 Mo de mémoire cache
  • 16 cœurs installés
  • Mémoire RAM 32 Go installée
  • Disque dur 500 Go
  • Localisation dans la salle de serveurs (climatisée)

  2. Vue d’ensemble des logiciels installés

La plupart des compilateurs sont disponibles sans manipulation particulière.
Les logiciels de calculs sont régulièrement maintenus à jour. Quelques rares cas sont accessibles sans manipulation particulière, la plupart nécessite l’utilisation des commandes « module » pour les activer. La commande « module avail » permet d’accéder à la liste des logiciels et des versions disponibles.

2.1 Système d’exploitation

  • Une distribution Debian 7.1 est installée sur la machine.

2.2 Compilateurs/debbugers disponibles

  • GCC (Gnu Compiler Collection) version 4.7.2 incluant :
    • gcc (Compilateur GNU pour C)
    • g++ (Compileur GNU pour C++)
    • gfortran (Compilateur GNU pour Fortran)
  • gp2c (Compileur GP vers C) en version 0.0.7pl5 et 0.0.9pl1(via module)
  • OpenMPI version 4.7.2 incluant :
    • mpicc (Wrapper pour C)
    • mpic++ (Wrapper pour C++)
    • mpif77 (Wrapper pour Fortran 77)
    • mpif90 (Wrapper pour Fortran 90)
  • Python version 2.6.8
  • Python version 2.7.3
  • Qt version 4.8.2
  • gdb (debbugueur GNU de la GCC) version 7.4.1
  • pdb (debbugueur python) version 2.6.8 et 2.7.3
  • GNU Make version 3.81
  • CMake version 2.8.9

2.3 Logiciels et librairies

  • FreeFem++ version 3.23 et 3.30 (via module)
  • FEniCS version 1.4.0 (via module)
  • FriCAS version 1.2.2 (via module)
  • Maple version 15 (via module)
  • Matlab version 2012a (via module)
  • Librairies MPI compilées sur la GCC 4.7.2
  • Pari/GP version 2.6.1 et 2.8.0 (via module)
  • Sage version 5.9 et 6.2 (via module)
  • Scilab version 5.4.1 (via module)
  • R est installé en version 2.15.1 (de base) 3.0.1 et 3.0.2 (via module)

2.4 Utilitaires

  • screen : Multiplexeur de terminaux interactifs permettant de gérer ses terminaux physiques par session depuis différents points de connexion
  • tmux : Alternative (un peu) plus conviviale à screen

 3. Accès au serveur et aux applications depuis un poste client

La documentation se trouve sur notre intranet.